Larry’nin oğlu Nick Daley, Doğa Tarihi Müzesi’nin yeni Gece Muhafızı olur. Ancak bodrum kapısını kilitlemeyi unutunca, eski bir düşman dünyayı ele geçirmek için yeni bir planla geri döner. Nick Daley’nin Doğa Tarihi Müzesi’nde gece bekçisi olarak yaptığı yaz işi, bir lise öğrencisi için zorlu bir iştir. Neyse ki babasının izinden gidiyor ve güneş battığında her şeye hayat veren eski tablete aşina. Nick, aralarında Teddy, Sacagawea ve Rex’in de bulunduğu eski arkadaşlarını gördüğüne sevinir. Ancak şeytani Kahmunrah, Mısır yeraltı dünyasını açığa çıkarıp Ölüler Ordusu’nu serbest bırakma planıyla kaçtığında, deli valiyi durdurmak ve müzeyi kesin olarak kurtarmak Nick’e kalır. Popüler film destanı ‘Müzede Bir Gece’nin animasyon uyarlaması.